В 2012-м году на самолёты Сухой Суперджет 100 пришлось 40% всех инцидентов, связанных с отказом авиационной техники, произошедших в «Аэрофлоте». Об этом пишет газета «Коммерсантъ» со ссылкой на презентацию компании о безопасности полётов. Согласно этому документу, в прошлом году число различных инцидентов в «Аэрофлоте» выросло до 95, хотя ещё в 2011-м их было 60. При этом, число происшествий, оцененных как «сложная ситуация», выросло до девяти против четырёх годом ранее. Около 63% инцидентов произошло в связи с отказом авиационной техники. 25% пришлось на внешние воздействия (например, попадание птиц в двигатель), еще 11% — на ошибки персонала.
24 инцидента с Суперджетом связаны с отказом авиационной техники. По данным компании, больше всего неисправностей приходится на системы кондиционирования и управления воздушным судном. 6 инцидентов приходится на сбои выпуска шасси — эти неисправности в «Аэрофлоте» считают наиболее серьёзными.
В компании-производителе лайнера «Гражданские самолёты Сухого» заявили, что все неполадки, возникшие у самолётов «Аэрофлота», уже устранены.
В настоящее время «Аэрофлот» эксплуатирует 10 построенных в Комсомольске лайнеров. Первый Суперджет компания получила в июне 2011-го года.