В соответствии с принятым решением совета директоров и собрания акционеров от 3 июня 2006 года, генеральным директором открытого акционерного общества “Комсомольское-на-Амуре авиационное производственное объединение имени Ю.А. Гагарина” (“КнААПО”) назначен Александр Иванович Пекарш. Совет директоров удовлетворил заявление Виктора Ивановича Меркулова с просьбой освободить его от обязанностей генерального директора в связи с уходом на заслуженный отдых, и назначили на эту должность Александра Ивановича Пекарша, занимавшего до последнего момента должность главного инженера компании. Александр Иванович направлен на завод в 1978 году после окончания Куйбышевского авиационного института им. С.П. Королева. При его техническом руководстве на объединении освоено серийное производство летательных аппаратов, отвечающих самым высоким современным требованиям, в том числе двухместного самолета СУ-30МК; создан летный образец гражданского самолета С-80; выполнены государственные задания на поставку иностранным заказчикам ряда изделий. В качестве председателя научно-технического совета объединения вносит значительный вклад в развитие научно-технического потенциала объединения. Является инициатором и создателем Инженерного центра объединения, обеспечивающего внедрение CALS-технологий и компьютеризацию проектных работ.
В рамах годового собрания, которое состоялось 3 июня 2006 года, генеральный директор авиационной холдинговой компании «Сухой» Михаил Асланович Погосян рассказал о результатах работы за 2005 год, в частности упомянул, что у объединения серьёзные заделки по гражданской тематике. Утверждён контракт по поставку 30 региональных самолётов RRG с компанией «Аэрофлот», а также имеются заявления на поставку 50-60 самолётов, которые в ближайшее время могут воплотиться в контракт. С 2009 года АХК «Сухой» планирует выйти на производство 30 самолётов в год, а поскольку головным предприятием избрано КнААПО, сборка самолётов будет осуществляться в Комсомольске-на-Амуре. Виктору Ивановичу Меркулову была вручена медаль, посвящённая 50-летию с начала серийного производства самолёта ?СУ-7?. Награда учреждена АХК «Сухой» в ознаменовании 50-летия плодотворного сотрудничества конструкторского бюро «Сухого» и КнААПО.